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張宏偉團隊研究發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)瘤診斷和治療或有新靶點首都醫(yī)科大學三博腦科醫(yī)院副院長張宏偉教授課題組研究發(fā)現(xiàn)了糖代謝相關(guān)基因GALM在膠質(zhì)瘤中高表達,可能為膠質(zhì)瘤的診斷和治療提供潛在的靶點。相關(guān)研究論文近日發(fā)表在國際雜志期刊《Frontiers in Cell and Developmental Biology》上。 膠質(zhì)瘤是最常見的原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,約占中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的40%,約占成人惡性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的78%。根據(jù)WHO分型,膠質(zhì)瘤共分為4個等級,I級和II級膠質(zhì)瘤細胞生長較緩慢,威力小,又稱作低級別膠質(zhì)瘤,III和IV級統(tǒng)稱為惡性膠質(zhì)瘤,占所有膠質(zhì)瘤的77.5%。惡性膠質(zhì)瘤中,最常見間變性膠質(zhì)瘤和膠質(zhì)母細胞瘤。目前,膠質(zhì)母細胞瘤的中位生存期為12~15個月,間變性膠質(zhì)瘤為2~5年,低級別膠質(zhì)瘤為4~10年。因此,膠質(zhì)瘤臨床診斷和治療的研究進展,對改善患者生活質(zhì)量和延長生命具有重要意義。 課題組首先在KEGG數(shù)據(jù)庫中獲取了11個糖代謝相關(guān)通路,其中包括289個糖代謝相關(guān)基因。通過在TCGA數(shù)據(jù)庫中分析這些基因在膠質(zhì)母細胞瘤和低級別膠質(zhì)瘤中的表達情況,篩選出48個差異表達的糖代謝相關(guān)基因,并構(gòu)建了包括6個糖代謝相關(guān)基因的預(yù)測模型。根據(jù)不同風險評分分組,評估該模型的臨床價值和免疫學特征。 為何選擇研究糖代謝相關(guān)基因GALM,張宏偉教授介紹,這是因為他們通過對模型中的6個葡萄糖代謝相關(guān)基因的回顧性調(diào)查時發(fā)現(xiàn),目前對GALM在膠質(zhì)瘤中的作用還知之甚少。為此,課題組決定進一步探究GALM潛在的價值。通過生物信息學分析和實驗驗證,課題組發(fā)現(xiàn)GALM高表達的患者預(yù)后更差,且表達量與腫瘤的分級顯著相關(guān)。 為了探究GALM高表達的原因,課題組進一步構(gòu)建了三組數(shù)據(jù),分別是去泛素化蛋白的表達水平數(shù)據(jù),去泛素化蛋白與GALM的相關(guān)性數(shù)據(jù),以及體外實驗過表達去泛素化蛋白觀察其對GALM影響的數(shù)據(jù)。篩選并驗證出TNFAIP3這一去泛素化蛋白可能是導致GALM高表達的因素。 張宏偉教授介紹,此次研究的意義主要在以下兩點:一是該研究構(gòu)建的糖代謝相關(guān)基因模型對預(yù)測膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后相比于WHO分級和分子病理學分類具有較好的準確性;二是該研究首次發(fā)現(xiàn)糖代謝相關(guān)基因GALM在膠質(zhì)瘤中高表達,并與膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后顯著相關(guān),對膠質(zhì)瘤細胞的EMT過程有促進作用,可能為膠質(zhì)瘤的診斷和治療提供潛在的靶點。 |