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山東米來(lái)生物科技有限公司

Shandong Milai Biotechnology Co., Ltd


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未來(lái)已來(lái)! 基因捕手NGS蓄勢(shì)待發(fā),推動(dòng)結(jié)直腸癌進(jìn)入精準(zhǔn)診療2.0時(shí)代

結(jié)直腸癌是我國(guó)常見(jiàn)的惡性腫瘤之一。近年來(lái),隨著生活方式的改變以及人口老齡化趨勢(shì)加重,我國(guó)結(jié)直腸癌發(fā)病率和死亡率始終保持上升趨勢(shì)。

世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)(International Agency for Research on Cancer,IARC)數(shù)據(jù)顯示,我國(guó)2020年結(jié)直腸癌的新發(fā)病例數(shù)為56萬(wàn)例,因結(jié)直腸癌死亡病例達(dá)29萬(wàn)例。其中,約25%的結(jié)直腸癌患者在確診時(shí)已出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。[1]此外,30%的患者在治療過(guò)程中發(fā)生轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者預(yù)后較差,5年生存率僅為11.7%。[2]

目前,中國(guó)已成為全球結(jié)直腸癌每年新發(fā)病例數(shù)和死亡病例數(shù)最多的國(guó)家,結(jié)直腸癌嚴(yán)重影響和威脅我國(guó)居民身體健康。[3]并呈現(xiàn)出男多女少、東多西少、城市遠(yuǎn)高于農(nóng)村的局面。[4]

如果結(jié)直腸癌患者錯(cuò)過(guò)了早期發(fā)現(xiàn)并及時(shí)診療的機(jī)會(huì),那么隨后不管是影像學(xué)評(píng)估、病理學(xué)評(píng)估、內(nèi)鏡、手術(shù)、化療、放療等任何一種診療手段的精準(zhǔn)程度都會(huì)影響患者的預(yù)后。

可喜的是,隨著診療水平的進(jìn)步以及靶向藥物、免疫治療的出現(xiàn),越來(lái)越多的結(jié)直腸癌患者跨越了5年生存期,實(shí)現(xiàn)了更長(zhǎng)的生存獲益。在轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者中,RAS基因野生型的患者能夠通過(guò)特定的精準(zhǔn)靶向治療藥物(如抗EGFR單抗)實(shí)現(xiàn)生存獲益,改善預(yù)后。

而這也進(jìn)一步推動(dòng)了以二代測(cè)序(NGS)技術(shù)為代表的靶向精準(zhǔn)檢測(cè)方法從科研實(shí)驗(yàn)室逐漸走向臨床實(shí)際應(yīng)用。

分子診斷作為精準(zhǔn)醫(yī)療的基石,無(wú)疑成為了腫瘤個(gè)體化診療應(yīng)用場(chǎng)景的“重要利器”。其中,NGS能夠一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,快速生成非常大的基因組學(xué)、表觀基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究數(shù)據(jù)集,無(wú)疑為精準(zhǔn)診斷提供了更大可能性。

從"檢"到"測(cè)",網(wǎng)羅全部"獵物"

眾所周知,基因檢測(cè)主要包括PCR、FISH、芯片技術(shù)、基因測(cè)序,而基因測(cè)序技術(shù)是基因檢測(cè)的一種;驕y(cè)序主要有一代測(cè)序(Sanger測(cè)序)、二代測(cè)序(NGS技術(shù))、三代測(cè)序(單分子測(cè)序)等。

PCR、FISH和芯片技術(shù),主要是通過(guò)已知序列去調(diào)查特定確定的片段序列或位點(diǎn)的有或無(wú),重點(diǎn)在“檢”,而基因測(cè)序技術(shù)是把基因序列上的核苷酸一個(gè)一個(gè)的測(cè)出來(lái),重點(diǎn)在“測(cè)”。[5]

如果將前幾種技術(shù)比作“一根魚(yú)竿在釣魚(yú)”的話,那么后者基因測(cè)序技術(shù)更像“一張漁網(wǎng)在撈魚(yú)”。特別是針對(duì)腫瘤細(xì)胞基因是不斷地發(fā)生突變,腫瘤組織也是動(dòng)態(tài)變化,每個(gè)時(shí)期所檢測(cè)出來(lái)的基因組可能都有發(fā)生變化的情況,更需要強(qiáng)有力的技術(shù)能在檢測(cè)過(guò)程中的“一網(wǎng)打盡”。

NGS必定責(zé)無(wú)旁貸。相比傳統(tǒng)的檢測(cè)技術(shù),它具有通量大、時(shí)間短、精確度高、信息量豐富等優(yōu)勢(shì)。并且,隨著技術(shù)的日趨成熟和成本的降低,NGS已經(jīng)被國(guó)內(nèi)外多個(gè)權(quán)威指南與共識(shí)推薦,用于癌癥研究領(lǐng)域和臨床實(shí)踐,也大大促進(jìn)了精準(zhǔn)醫(yī)療理念“落地開(kāi)花”。

例如,國(guó)內(nèi)CSCO和NCCN指南中都對(duì)晚期結(jié)直腸癌患者的生物標(biāo)志物有一定的推薦,建議進(jìn)行KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA等基因檢測(cè),以便更好地指導(dǎo)臨床用藥。

而現(xiàn)行的檢測(cè)方法中,一般都是單基因的檢測(cè),以PCR和FISH這兩種方法占比比較多。NGS檢測(cè)則可以實(shí)現(xiàn)一次性檢測(cè)多種生物標(biāo)記物,既能節(jié)約腫瘤患者珍貴的組織樣本,還能更好地滿足臨床和患者的檢測(cè)需求,從而大大提升了腫瘤治療的精準(zhǔn)性。

從技術(shù)到產(chǎn)品,結(jié)直腸癌精準(zhǔn)診斷“利器”顯身手

利好的消息是,今年3月3日,臻和科技自主研發(fā)的結(jié)直腸癌NGS多基因伴隨診斷試劑盒已經(jīng)獲批上市,這也是國(guó)內(nèi)首款專注于結(jié)直腸癌的NGS伴隨診斷試劑盒。

臻和結(jié)直腸癌試劑盒(可逆末端終止測(cè)序法)

這是一款基于NGS平臺(tái)的多基因位點(diǎn)的伴隨診斷產(chǎn)品,可用于體外定性檢測(cè)結(jié)直腸癌患者腫瘤樣本中與靶向治療密切相關(guān)的KRAS、NRAS、BRAF和PIK3CA基因的多種突變狀態(tài),篩選適合接受靶向藥物治療的患者。

據(jù)悉,該產(chǎn)品歷經(jīng)近兩年時(shí)間,在包括復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院、四川大學(xué)華西醫(yī)院、天津市腫瘤醫(yī)院、河南省腫瘤醫(yī)院、北大人民醫(yī)院等頂尖醫(yī)院在內(nèi)的八家臨床中心,累計(jì)完成1400多例臨床樣本。

最終研究結(jié)果顯示,該款試劑盒在KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA的最低檢出限為1%,與已上市產(chǎn)品或者金標(biāo)準(zhǔn)相比,符合率超過(guò)99%,達(dá)到了國(guó)內(nèi)領(lǐng)先水平。這也是目前市場(chǎng)上參與中心最多、完成臨床樣本驗(yàn)證最多的結(jié)直腸癌NGS伴隨診斷產(chǎn)品。

該試劑盒兼容性更強(qiáng),可匹配MiSeqDx和NextSeq CN500高低兩種通量的測(cè)序平臺(tái),供用戶靈活選擇。

對(duì)于這款試劑盒的獲批,北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院薛衛(wèi)成教授曾表示,這說(shuō)明國(guó)家、政府和行業(yè)主管部門逐漸開(kāi)始“擁抱”新技術(shù),也意味著相應(yīng)的檢測(cè)技術(shù)只要合規(guī)、合法,且操作便捷,就能迅速地應(yīng)用到日常診療過(guò)程。

從產(chǎn)品到整體解決方案,NGS檢測(cè)一站式平臺(tái)“落地”

精準(zhǔn)是腫瘤治療的先進(jìn)理念,病理科的精準(zhǔn)診斷則是這一理念實(shí)施的“必經(jīng)之路”。病理診斷一直被視為腫瘤診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”,其水平的高低直接影響醫(yī)療機(jī)構(gòu)的診斷能力。

NGS不僅在腫瘤診斷與伴隨診斷中發(fā)揮著重要作用,還在疾病早期篩查、腫瘤治療療效評(píng)估、腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估等領(lǐng)域發(fā)揮著不可替代的作用。

但現(xiàn)實(shí)中,極具優(yōu)勢(shì)的NGS卻在醫(yī)院病理科應(yīng)用情況不佳。其主要原因在于,NGS檢測(cè)技術(shù)流程復(fù)雜,試劑盒質(zhì)量、建庫(kù)、報(bào)告解讀,以及人員能力、場(chǎng)地、污染等因素制約著落地應(yīng)用。其中任何一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題,均會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,進(jìn)而影響臨床決策。

公眾對(duì)醫(yī)療需求的日益增長(zhǎng),病理診斷的工作量不斷加大,患者對(duì)病理診斷的準(zhǔn)確性和時(shí)效性也都提出了更高的要求。醫(yī)院亟需標(biāo)準(zhǔn)化、自動(dòng)化、結(jié)果準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)便的產(chǎn)品。

秉承“以臨床需求為導(dǎo)向”的發(fā)展理念,著眼于NGS技術(shù)落地難以及業(yè)內(nèi)需求迫切的現(xiàn)狀,臻和科技打造出一整套完善、可靠且有創(chuàng)新性的IVD整體解決方案,包括Genecast Genius G1全自動(dòng)樣品處理系統(tǒng)及Genecast INTEGRO V1.0 全自動(dòng)生信分析一體機(jī)等重磅產(chǎn)品,全面助力NGS技術(shù)在醫(yī)院的落地。

Genecast Genius G1全自動(dòng)樣品處理系統(tǒng)

其中,Genecast Genius G1 全自動(dòng)樣品處理系統(tǒng)采用集成化設(shè)計(jì),預(yù)置高精密移液系統(tǒng)、PCR儀、恒溫/震蕩等功能模塊,以及全面的防污染設(shè)置,NGS建庫(kù)的各個(gè)環(huán)節(jié)大部分能在該設(shè)備上自動(dòng)化完成,盡可能地減少人為干擾,有效降低人員和實(shí)驗(yàn)室投入,全面提升實(shí)驗(yàn)室整體工作效率和運(yùn)行穩(wěn)定性。

Genecast INTEGRO V1.0 全自動(dòng)生信分析一體機(jī)

Genecast INTEGRO V1.0 全自動(dòng)生信分析一體機(jī),該產(chǎn)品是高性能、全自動(dòng)、可拓展的生物分析系統(tǒng)和數(shù)據(jù)管理一站式服務(wù)平臺(tái)。它集數(shù)據(jù)管理、生信分析、結(jié)果展示、報(bào)告解讀于一體,最大程度滿足腫瘤基因檢測(cè)對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控管理、分析速度、報(bào)告解讀等臨床應(yīng)用需求。

此外,臻和科技自主開(kāi)發(fā)的專利核心算法和安全存儲(chǔ)技術(shù),可以保障運(yùn)行過(guò)程中的分析準(zhǔn)確和數(shù)據(jù)安全。

“我們希望能夠更好地為醫(yī)院和醫(yī)生賦能,借助更多的工具和手段對(duì)抗癌癥,讓患者擁有更好的治療方式和生命質(zhì)量!闭楹涂萍紕(chuàng)始人兼CEO杜波表示。

從理念到行動(dòng),提速精準(zhǔn)診療進(jìn)程

需求端的拉動(dòng),技術(shù)端的成熟,使用端的期盼……多種因素加速了NGS檢測(cè)在醫(yī)院落地。

據(jù)了解,目前國(guó)內(nèi)很多頂級(jí)三甲醫(yī)院,比如北京協(xié)和醫(yī)院病理科、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院病理科等機(jī)構(gòu)都根據(jù)臨床的需要,依托自身醫(yī)學(xué)分子實(shí)驗(yàn)室的強(qiáng)大技術(shù)實(shí)力,為臨床治療提供專業(yè)的測(cè)序檢測(cè)及專業(yè)的數(shù)據(jù)解讀病理報(bào)告。

但目前,NGS儀器及試劑組合多樣化,不同平臺(tái)技術(shù)要求不同,這又對(duì)檢測(cè)質(zhì)量帶來(lái)諸多挑戰(zhàn)。

那么,該如何保證樣本的檢測(cè)質(zhì)量?這就需要從樣本到出具報(bào)告的每個(gè)環(huán)節(jié)都需要進(jìn)行質(zhì)控,其中包括樣本DNA/RNA質(zhì)控、DNA文庫(kù)質(zhì)控等,只有經(jīng)過(guò)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)馁|(zhì)控才能確保報(bào)告結(jié)果的準(zhǔn)確性。

其中,最關(guān)鍵的還是NGS檢測(cè)對(duì)樣本質(zhì)量要求,NGS的檢測(cè)首先在組織切片方面要求一定的腫瘤占比(一般要求在20%以上)。過(guò)低的腫瘤含量會(huì)直接影響結(jié)果,影響基因檢測(cè)突變豐度的讀取,會(huì)造成一定的假陰性。而血液樣本要注重核酸提取重復(fù)性和提取效率、純度、片斷是否滿足NGS檢測(cè)的需求。

此前,國(guó)家相關(guān)機(jī)構(gòu)相繼出臺(tái)一系列措施對(duì)基因測(cè)序行業(yè)進(jìn)行監(jiān)管,相關(guān)行業(yè)學(xué)會(huì)和協(xié)會(huì)也紛紛出臺(tái)相關(guān)的指南與共識(shí),比如,中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)靶向治療專業(yè)委員會(huì)就聯(lián)合相關(guān)專家與企業(yè)聯(lián)合發(fā)布了2021版《結(jié)直腸癌分子檢測(cè)高通量測(cè)序中國(guó)專家共識(shí)》,以規(guī)范NGS檢測(cè)技術(shù)在腫瘤診療中的規(guī)范應(yīng)用。

相信未來(lái)隨著技術(shù)手段的不斷進(jìn)步、研究探索的不斷開(kāi)展,人們對(duì)腫瘤的了解不斷深化,腫瘤診療必定會(huì)結(jié)合患者生物學(xué)特點(diǎn)、基因?qū)W特點(diǎn)或其他特征對(duì)人群進(jìn)行精細(xì)化分層,NGS檢測(cè)必將“大有作為”。

對(duì)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)而言,NGS檢測(cè)將成為病理科醫(yī)生強(qiáng)有力的技術(shù)支撐,進(jìn)而為臨床醫(yī)生的精準(zhǔn)治療決策提供可靠的參考依據(jù);對(duì)于患者來(lái)說(shuō),NGS檢測(cè)將使患者有希望得到更精準(zhǔn)的診斷和治療,從而進(jìn)一步延長(zhǎng)生存期和提升生活質(zhì)量;而生物科技公司則需要做好技術(shù)創(chuàng)新研發(fā),細(xì)分產(chǎn)品,為疾病診斷提供最精準(zhǔn)化工具;全方位地推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展,為實(shí)施健康中國(guó)戰(zhàn)略“添磚加瓦”。

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